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这些矛盾意味着科学哲学是一个辩证的过程。
概念从未与存在一致。
在伊壁鸠鲁和马克思看来，矛盾总是存在于概念和现实之间，因此概念和现实之间的关系总是辩证的。
形式总是为内容所否定，而否定在知识建构中是始终存在的因素。
同样，概念和存在之间总是矛盾的。
本质指的是事物的内部，而存在指的是现实。
正如概念不可能获得存在，它也不可能获得本质。
因此，概念和本质之间的关系是辩证的。
或者说，本质总是否定概念。
根据马克思的解释，伊壁鸠鲁坚持辩证的科学哲学。
它基于概念和存在以及概念和本质的对应关系，而知识的发展是由否定的力量推动前进的。
马克思解释伊壁鸠鲁的方式为他后来解释社会发展提供了范例。
马克思在1839～1841年赞同的科学哲学与他后来用于历史唯物主义的科学哲学是同一个范畴，采用的是同一种方法。
马克思对德谟克利特哲学的轻视在我所引用的材料中显得很清楚。
尽管标题是“德谟克利特的自然哲学和伊壁鸠鲁的自然哲学的差别”
，但其博士论文的大部分内容都致力于研究伊壁鸠鲁。
德谟克利特的科学哲学认为，理念是感性知觉的表象。
不同于伊壁鸠鲁，德谟克利特没有把握概念的优先性，而是理所当然地认为，理念是外部世界的表象。
德谟克利特是18世纪至19世纪经验主义的古代先驱，而马克思放弃了德谟克利特的传统。
在第二部分第三章“不可分的本原和不可分的元素”
中，马克思还用如下几段话来描述伊壁鸠鲁的科学哲学：
原子概念中所包含的存在与本质、物质与形式之间的矛盾，表现在单个的原子本身内，因为单个的原子具有了质。
由于有了质，原子就同它的概念相背离，但同时又在它自己的结构中获得完成。
于是，从具有质的原子的排斥及其与排斥相联系的聚集中，就产生出现象世界。
在这种从本质世界到现象世界的过渡里，原子概念中的矛盾显然达到自己的最尖锐的实现。
因为原子按照它的概念是自然界的绝对的、本质的形式。
这个绝对的形式现在降低为现象世界的绝对的物质、无定形的基质了。
原子诚然是自然界的实体，一切都由这种实体产生，一切也分解为这种实体，但是，现象世界的经常不断的毁灭并不会有任何结果。
新的现象又在形成，但是作为一种固定的东西的原子本身却始终是基础。
①
在上述三段话中，马克思再次回归矛盾的主题。
原子的概念往往是存在和本质的矛盾和冲突。
但马克思进一步指出本质和现象之间的辩证关系。
在他发现劳动是社会存在的DNA之后，本质和现象之间的辩证关系对分析社会的方法而言就是关键的了。
若不将本质和现象作为相互解释的话语，《资本论》就无法为人所理解。
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