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不仅不依赖任何教条，而且从怀疑这些教条开始；他主张从一些最清晰明白的命题出发，由此推出同样确实的未知的新真理。
他认为，我们得到的观念有可能都是错的，感觉也在欺骗我们，一切都可能是假的。
上帝、万物、身体可能都不存在，而只有一件事是确实的，那就是我在怀疑，在怀疑一切是不是真的，只有“我在怀疑”
这一点是无可怀疑的。
怀疑亦即在思维。
因此，怀疑、思维就意味着存在着一个怀疑者，一个思维者，这就是著名的“我思故我在”
的命题。
它完全摆脱了宗教神学的那套思维模式，走出了神学的藩篱。
“我思故我在”
这个命题的影响是十分深远的，直到当代的现象学，直到萨特，都认为必须以“我思”
（cogito）为哲学的出发点，虽然他们对“我思”
的解释各有不同。
帕斯卡尔也是反经院哲学，反古代权威的。
他对他前面的那套烦琐的、固守着神学教条的哲学体系不感兴趣；那些传统的观念，只要与事实相悖，他就大胆地将其推翻。
比方说，从亚里士多德到经院哲学，一直流行着“自然畏惧真空”
这样一个错误观念。
他在经过一系列实验之后，写下了《真空论》一文，指出这个观念是荒谬的，并认为追求真理不能墨守古代权威的教条，今人能够超过古人，后人能够超越前人，不应盲目崇古。
在历史、古代语言、神学方面，古代人可以做权威，“但在涉及感觉、理智的科目上情况就不同了，权威在此是无用的，只有理智能了解它们”
，“这些学科，如几何、算术、音乐、物理、医学、建筑以及所有依赖于试验和推理的科学，为了完善都应扩大”
。
[2]他认为自然的秘密是隐藏着的，需要一代代人不断地将其揭露。
而且，他不单重视推理和思维，还强调观察和试验。
他不仅重视对经验的观察和综合，而且强调人为地改变各种事实条件，进行有目的、有步骤的实验。
他的这些思想与现代科学的精神无疑是相通的。
第二，笛卡儿和帕斯卡尔都借鉴和改造了某种怀疑论作为他们的出发点，或者说作为他们的方法和对象。
蒙田在他的《随笔集》中，表现出某种怀疑论的倾向。
他自问“我知道什么呢？”
认为只有通过怀疑才能达到判断和论定。
他的怀疑主要是对盲目的信仰而言，是对宗教神学的怀疑；但也流露出一种一般的不可知论的倾向。
这种倾向被后来的彼埃尔·夏隆发展了，他在《论智慧》中把蒙田的名言“我知道什么？”
改为“我一无所知”
。
怀疑论的源头则可以上溯到古希腊的皮浪主义。
皮浪主义认为我们不能认识事物的本性，我们的感性认识和理性认识都不可靠，因而对形而上学问题不要做出判断。
笛卡儿的哲学的逻辑起点可以说是怀疑一切，但他是把怀疑作为某种积极的方法、手段，而非一种消极的目的和结论。
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